Tranh cãi nổ ra sau chiến thắng 3-0 của Việt Nam trước Malaysia. Cụ thể, Việt Nam với hiệu số +5 (ghi 5 bàn, thủng lưới 0) được BTC AFF Cup 2020 xếp vị trí số 1. Xếp thứ 2 là Indonesia với hiệu số +6 (ghi 9 bàn, thủng lưới 3). Và xếp thứ 3 là Malaysia với hiệu số +3 (ghi 7 bàn, thủng lưới 4 lần).

Tuy nhiên, BXH của wikipedia cùng một số trang dữ liệu lớn trên thế giới lại đảo ngược hai vị trí thứ 1 và thứ 2 của Việt Nam, Indonesia lại. Vấn đề nằm ở điều lệ giải năm nay có sự thay đổi lớn so với những năm trước.

Nếu như từ năm 2018 trở về trước, cách phân hạng các đội theo thứ tự: Điểm số, hiệu số bàn thắng bại, số bàn thắng. Nếu có từ 2 đội trở lên bằng nhau ở 3 tiêu chí này thì mới xét đến thành tích đối đầu trực tiếp giữa các đội liên quan.

Tuy nhiên ở năm 2020, cách phân hạng ưu tiên theo thứ tự: Điểm số, thành tích đối đầu trực tiếp giữa các đội bằng điểm rồi mới tính đến các tiêu chí khác như hiệu số bàn thắng bại, số bàn thắng…

Tính đến hiện tại, Việt Nam, Malaysia và Indonesia đang có cùng 6 điểm chung cuộc. Đối chiếu theo tiêu chí và điều lệ của AFF Cup 2020, Việt Nam đang có 3 điểm khi đối đầu trực tiếp (thắng Malaysia, hiệu số +3). Trong khi Indonesia xếp thứ 2 với 0 điểm (chưa gặp Việt Nam lẫn Malaysia) và Malaysia đang có 0 điểm (thua Việt Nam, hiệu số -3).