Năm 2017, Ljungberg rời Arsenal để làm trợ lý Andries Jonker tại Wolfsburg. Tuy nhiên, chỉ vỏn vẹn 6 tháng sau, cựu tiền vệ của Pháo thủ cùng Jonker bị đại diện Bundesliga sa thải.
Trước đó, Ljungberg cũng từng có quãng thời gian dẫn dắt đội U15 Arsenal và làm trợ lý cho đội U19 tại UEFA Youth League ở mùa 2016/17. Chia sẻ về việc bổ nhiệm Ljungberg, giám đốc học viện Arsenal - Per Mertesacker nói: "Thật vui khi Freddie trở lại CLB. Anh ấy sẽ mang đến kinh nghiệm, sự nhiệt huyết và năng lượng lớn nhất cho các cầu thủ trẻ Arsenal.
Freddie hiểu những giá trị của Arsenal, hiểu tầm quan trọng để giúp các cầu thủ trẻ cơ hội trưởng thành và phát triển. Khi anh ấy rời Wolfsburg, đó là niềm vui của CLB và ai nấy đều nghĩ rồi anh ấy một ngày nào đó sẽ quay về đội bóng. Mọi người biết Freddie yêu CLB và chúng tôi muốn anh ấy phát triển sự nghiệp với đội bóng".
Trong quá khứ, Ljungberg đã ghi 46 bàn sau 216 trận cho Arsenal, cùng Pháo thủ đoạt 2 chức vô địch Ngoại hạng Anh, bao gồm chiến tích bất bại mùa 2003/04, và 3 lần đăng quang tại FA Cup.