Torres được đôn lên đội 1 Atletico vào năm 2001 (thời điểm đội bóng này đang phải chơi tại giải hạng Nhì), khi mới 17 tuổi. Hai năm sau, anh đã giúp Atletico trở lại La Liga và được trao băng đội trưởng khi mới 19 tuổi.
El Nino thăng tiến không ngừng từ đó. Anh đều là chân sút, ngôi sao số một của CLB, được xem như biểu tượng tại Vicente Calderon. Tuy nhiên, với khát khao chinh phục đỉnh cao, El Nino rời Atletico để gia nhập Liverpool vào năm 2007.
Sự nghiệp của Torres tiếp tục thăng hoa trong màu áo Liverpool. Anh vươn lên trở thành một trong những chân sút hàng đầu thế giới tại đây. Nhưng dù chơi tỏa sáng, Torres vẫn không giành được bất cứ danh hiệu nào trong 3 mùa rưỡi chơi tại Anfield.
Torres một lần nữa tìm kiếm bến đỗ lớn hơn. Lần này là CLB tỷ phú và đầy tham vọng Chelsea. Anh gia nhập The Blues với mức phí chuyển nhượng 50 triệu bảng, kỷ lục tại Anh lúc đó, ngay trong thị trường chuyển nhượng mùa Đông năm 2011. Nhưng kể từ đó, sự nghiệp của anh xuống dốc không phanh.
Phải đến trận thứ 14, anh mới có bàn đầu tiên cho CLB mới. Và đó cũng chính là bàn duy nhất của anh ở mùa đầu tại Stamford Bridge. El Nino từng có những khoảnh khắc lóe lên trong màu áo Chelsea, như pha lập công ấn định chiến thắng 3-2 trước Barca ở trận bán kết lượt về Champions League 2012/13; hay bàn mở tỷ số trong chiến thắng 2-1 của Chelsea trước Benfica tại chung kết Europa League mùa kế tiếp, qua đó giúp đội nhà đăng quang. Tuy nhiên, vẫn có thể nói, Torres đã từ con thiên nga rực rỡ đã trở thành con quạ xấu xí chỉ sau hơn 3 năm rưỡi tại Chelsea. Bởi thời gian anh mang niềm vui đến cho The Blues vẫn là rất ngắn ngủi so với những tháng năm thất vọng tràn trề của chân sút 30 tuổi này.
Phải đến đầu mùa này, đầu mùa này Torres mới chịu rời Chelsea để tìm cơ hội cứu vãn sự nghiệp khi chấp nhận chuyển đến Milan. Song thành tích chỉ ghi được 1 bàn sau nửa mùa đầu tại CLB Italia khiến sự nghiệp El Nino càng bị đẩy vào đường cùng. Nhưng rất may, Atletico vừa chấp nhận dang tay cứu vớt “đứa con lầm lỗi” trở về.
