Trước đó, Heynckes được BLĐ Bayern Munich mời lại sân Allianz theo hợp đồng tới cuối mùa giải 2017/18 sau khi sa thải HLV Carlo Ancelotti. Dưới thời Heynckes, Bayern đã trở lại đầy mạnh mẽ khi lúc này họ đang dẫn đầu trên BXH Bundesliga, lọt vào bán kết cúp Quốc gia Đức và gần như chắc chắn có vé dự tứ kết Champions League.
Dù vậy, Heynckes cũng không muốn gia hạn thêm dù phía "Hùm xám" hi vọng sẽ giữ chân ông thêm một thời gian nữa. Từng có thông tin cho rằng Julian Nagelsmann (Hoffenheim) là ứng viên số 1 thay thế cho Heynckes nhưng chính người đàn ông 72 tuổi này lại không nghĩ thế.
Trong buổi phỏng vấn với Sport Bild mới đây, Heynckes đã đề xuất người kế vị mình: “Thomas Tuchel có đủ phẩm chất để dẫn dắt Bayern. Tôi đánh giá cao Tuchel. Cậu ấy vẫn tiếp tục phát triển kể từ điểm khởi đầu là dẫn dắt các đội trẻ ở Mainz. Đó là những nấc thang đến thành công mà bạn buộc phải bước đi, học hỏi cách tiếp cận đúng đắn và những kĩ năng về mặt con người.
Dưới thời Tuchel, Dortmund đã chơi thứ bóng đá tuyệt vời với một hệ thống tốt cùng tất cả những yếu tố của bóng đá hiện đại. Tôi luôn rất thích xem Dortmund chơi bóng và đó là lý do tại sao tôi tôn trọng cũng như đánh giá cậu ấy là một HLV tốt”, Heynckes nhấn mạnh.
