Armenia và Azerbaijan từ lâu đã có tranh chấp về khu vực Nagorno-Karabakh và căng thẳng đang leo thang. Vì thế Mkhitaryan đã quyết định không cùng các đồng đội đến thủ đô Baku để đối đầu với Qarabag trong khuôn khổ loạt trận thứ 2 bảng E ở Europa League 2018/19.
UEFA cũng tuyên bố đó là "quyết định của Arsenal" và Mkhitaryan "không được tham dự trận đấu này vì lý do an ninh". Khi còn thi đấu cho Dortmund, Mkhitaryan cũng từng từ chối tham dự 1 trận đấu ở Europa League 2015/16 với Gabala của Azerbaijan cũng vì lý do tương tự.
Khi được hỏi về vụ việc của Mkhitaryan, HLV Unai Emery cho biết: "Công việc của tôi là bóng đá. Tôi không quan tâm lắm đến các xung đột chính trị. Tôi tôn trọng quyết định của Micky và chúng tôi đến Azerbaijan với mục tiêu giành lấy 3 điểm. Các cầu thủ đang có tinh thần rất tốt và chúng tôi đã có sự chuẩn bị kỹ càng".
Mkhitaryan sẽ không tham dự trận đấu với Qarabag vì lý do chính trị
Trận chung kết Europa League 2019 sẽ được tổ chức tại Baku. Khi được hỏi liệu Mkhitaryan có đến Azerbaijan nếu như Arsenal lọt vào chung kết hay không, Emery đã từ chối bình luận. Ông trả lời: "Còn quá sớm để nói tới trận chung kết. Việc cần làm bây giờ chỉ là chuẩn bị cho trận đấu tiếp theo".
Huấn luyện viên trưởng của Qarabag, Gurban Gurbanov, tuyên bố Arsenal đã "cố gắng cứu" Mkhitaryan khỏi "áp lực" khi chơi ở Azerbaijan. "Tôi không muốn chính trị làm gián đoạn môn thể thao này nhưng chúng tôi chẳng thể làm bất cứ điều gì trong vụ việc này", ông nói.
"Nếu Henrikh Mkhitaryan đến Azerbaijan thì đây không phải là lần đầu tiên một vận động viên người Armenia đến Azerbaijan nhưng đó là sự lựa chọn của Arsenal. Và họ đã chọn không để anh ấy ra sân. Arsenal có thể sợ rằng trước 60.000 người hâm mộ Azerbaijan, Mkhitaryan sẽ gặp áp lực và không thể hiện được gì", HLV Gurbanov cho biết thêm.
