Godin gia nhập Atletico từ Villarreal vào mùa Hè 2010 và đã nhanh chóng tạo được sự tin tưởng tuyệt đối nhờ khả năng chỉ huy hàng thủ. Cũng nhờ luôn thi đấu xuất sắc và trở thành tấm lá chắn an toàn nhất trong hệ thống phòng thủ nên suốt nhiều năm qua, Godin gần như là cầu thủ không thể thay thế tại Atletico. 

Có thể nhìn thấy tầm ảnh hưởng và những đóng góp quan trọng của Godin vào thành công của Atletico trong 7 mùa bóng anh khoác áo Los Rojiblancos. Anh đều là “hạt nhân” giúp đội bóng này giành 6 danh hiệu gồm 1 Europa League, 2 Siêu Cúp châu Âu, 1 Cúp Nhà Vua, 1 Siêu Cúp Tây Ban Nha và 1 La Liga 2013/14. Dấu ấn lớn nhất của Godin là pha đánh đầu trong trận hòa 1-1 trước Barca ngay tại Nou Camp, qua đó giúp Atletico lên ngôi vua bóng đá Tây Ban Nha ngay ở vòng đấu cuối cùng của mùa giải 2013/14.

Trong 300 trận đấu cho Atletico, người đội trưởng gương mẫu này cũng đã đóng góp được 22 bàn thắng. Nhưng Godin còn là mẫu người không bao giờ để xuất hiện suy nghĩ tự mãn với thành công. Anh vẫn tập luyện miệt mài trong từng buổi tập với khát vọng chinh phục những thành tích khác, mà theo Godin, trước mắt là quyết tâm cùng Atletico vô địch Champions League 2016/17, kế đến là vượt qua kỷ lục cầu thủ nước ngoài khoác áo Atletico nhiều nhất trong lịch sử (314 trận) của cựu hậu vệ người Colombia, Luis Perea.