Năm 2015, Xuân Trường đối diện với ca chấn thương khó chịu đầu tiên. Quãng thời gian chơi bóng liên tục ở đội U19 Việt Nam và phần nào là HAGL ở V.League khiến tiền vệ này bị quá tải gân cơ khép và cơ thẳng bụng, dẫn tới việc không thể tham gia vòng loại U23 châu Á 2016.
Sau năm 2016 thi đấu với phong độ cao trong màu áo ĐTQG, Xuân Trường đã được Gangwon FC của Hàn Quốc để mắt. Đáng tiếc, anh không thể “chào sân” đội bóng Hàn Quốc trong 3 tuần đầu tiên vì bị chấn thương dây chằng cổ chân.
Tới năm 2018, Xuân Trường phải bước vào một ca tiểu phẫu cuốn mũi, điều từng khiến anh bị khó thở, dẫn tới ảnh hưởng đến quá trình tập luyện và thi đấu bóng đá. Cũng vì ca tiểu phẫu này mà Xuân Trường lỡ hẹn 4 trận đấu ở V.League trong màu áo HAGL.
Trong buổi tập cùng ĐT Việt Nam chuẩn bị cho vòng loại World Cup 2022, Xuân Trường đã gặp một chấn thương. Kết quả chụp khám khiến tiền vệ này chết lặng. Anh bị xác định là đứt dây chằng chéo trước ở đầu gối. Điều đó buộc Xuân Trường phải sang Hàn Quốc chữa trị và phải nghỉ thi đấu bóng đá tới 9 tháng.
Đầu năm 2023, Xuân Trường quyết định nói lời chia tay HAGL để đến đầu quân cho Hải Phòng. Nhưng ngay ở mùa giải đầu tiên gắn bó với đội bóng mới, thay vì những ấn tượng được thể hiện trên sân cỏ, Xuân Trường lại liên tục phải nghỉ thi đấu vì chấn thương. Đầu năm nay, vì bị rách bắp trong trận giao hữu với CLB Công an hà Nội mà Xuân Trường phải nghỉ từ 4-8 tuần. Chưa dừng lại ở đó, mới đây, vì bị rạn nứt cơ đùi khi tập luyện mà Trường lại phải nghỉ thêm 2 tháng nữa. Đó cũng là thời điểm mà V.League 2023 của Hải Phòng cũng dần hạ màn.
